داستان درباره دختری به نام توتوچان است که به دلیل رفتارهای غیرمتعارف از مدرسه ابتدایی اخراج می‌شود. والدینش او را در مدرسه‌ای غیرمتعارف به نام "توموئه گاکوئن" ثبت‌نام می‌کنند که در آن یادگیری با آزادی، خلاقیت و عشق همراه است. در این محیط جدید، توتوچان دوستان جدیدی پیدا کرده و تجربیات تازه‌ای کسب می‌کند. اما با فرا رسیدن جنگ جهانی دوم، زندگی او و مدرسه‌اش دستخوش تغییرات بزرگی می‌شود.